Overview 最近需要用到数个Python程序处理蛋白质序列以输出特征值,而这些Python文件需要在Shell脚本中传入文本文件(该文本文件记录了某些蛋白质序列)做参数,进而依次被Shell调用。我们在Java程序中建立Shell脚本的运行时环境Runtime,这其中用到了一个类,即java.lang.Runtime,下面对该类进行探讨和记录。 1.直接运行Shell命令 java....阅读全文>>
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The First Step To Use Weka
Overview Weka is easy to use when we do feature selection and classification. Using Weka's friendly graphic user interface, we can try and validate multiple feature selection methods and classifie...阅读全文>>
Java处理文件名加时间戳
Overview 第一个项目中,输入框内的sequence传入后台,并在Action中用String类型的seq接收,继而处理成txt文件形式保存。由于以后的项目均要频繁使用io以及这种中间处理方式,故在参考了前人的类似处理方法之后,提取出适合本项目的Java类FileTimeStamp。 该Java类负责以“sequence_input_时间戳”的形式命名文本文件。以下便是该处理类的代码...阅读全文>>
Perl处理文件Tips
Overview 最近经常需要使用到Perl处理文件,因此在此记录一下经常使用到的Perl知识。 1. Perl脚本中接受命令行参数 很多时候我们编写一个Perl脚本,都是用来处理一个文件,输出为另一个文件,例如,脚本file_converter.pl将input.txt中的格式处理之后转化为另一种格式存储在output.txt中,则通常我们的使用习惯是 ./file_converter.p...阅读全文>>
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