Overview 之前将SecretEPDB部署到了云服务器上之后，再打开需要连接数据库的网页时总是会出现莫名其妙的错误，之前一直没管它，主要是因为这个错误不是每次都出现，出现之后刷新几次又可以访问了。 1. 错误描述 每次打开需要连接数据库的网页，就很有很大概率出现下面的错误信息： Struts Problem Report Struts has detected an unhandl...阅读全文>>

Overview 这里只是总结一下secretepdb这个项目用到的Hibernate的特性，Hibernate本身细节极其多，不太可能全部记得下来，也没有必要去记，用到的时候去查就可以了，而且Hibernate的设计也都是很符合常理的，所以用正常的思维去想，一般都能理得顺。 1. 初识Hibernate 阅读全文>>

Overview secretepdb这个项目需要展现一些统计图表，我们使用了google的gchart，图表的数据源从数据库异步获取。这里就用到了Struts2和Jquery Ajax的集成。本身都是很规范的东西，应该不会出什么问题，但是特定条件下里面有个坑，在这里梳理一遍。 既然是Struts2跟Ajax集成，肯定也会用到Struts2本身的一些东西，可以先看看我之前写的：Struts...阅读全文>>

Overview 最近我跟Young在开发secretepdb这个项目时，遇到了很多跟Struts2和Hibernate相关的问题，在这里记录Struts2的相关信息和问题。其实Young在 PhosphoPrediction项目总结 已经总结了Struts2的很多东西，再写一篇是想把所有相关的写在一起，方便参考。 1. Struts2的配置 先去 Struts2官网 上下载一个完整的包，...阅读全文>>

Overview PhosphoPrediction项目是Chris和我做的一个新项目，主要是为本地客户端程序添加一个相同功能的web server。由于出差新疆，只能晚上回酒店自己加班写代码，在Chris的帮助下，前前后后忙了大约两周总算有了个不错的小成果，心中颇感欣慰。这段时间，Chris不仅给了我技术上的指导，更给我排解了心中的许多烦恼，在此感谢我最好的朋友Chris(我知道你不喜欢...阅读全文>>

Overview 最近需要用到数个Python程序处理蛋白质序列以输出特征值，而这些Python文件需要在Shell脚本中传入文本文件（该文本文件记录了某些蛋白质序列）做参数，进而依次被Shell调用。我们在Java程序中建立Shell脚本的运行时环境Runtime，这其中用到了一个类，即java.lang.Runtime，下面对该类进行探讨和记录。 1.直接运行Shell命令 java....阅读全文>>

Overview 第一个项目中，输入框内的sequence传入后台，并在Action中用String类型的seq接收，继而处理成txt文件形式保存。由于以后的项目均要频繁使用io以及这种中间处理方式，故在参考了前人的类似处理方法之后，提取出适合本项目的Java类FileTimeStamp。 该Java类负责以“sequence_input_时间戳”的形式命名文本文件。以下便是该处理类的代码...阅读全文>>

代码生成器的使用 正如许多J2EE整合开发框架一样，Jeesite也提供了代码生成器，我们可以通过配置，利用它来生成一个独立模块的各层次的基础部分，其中包括： Entity,即实体类。对应MVC的Model部分。其继承了Common模块中的模板类BaseEntity。 DAO层，封装了对实体类的CRUD操作，相应地继承了模板类BaseDAO。 Service层，封装底层，并加了一些基础功能...阅读全文>>

Overview 主要使用使用Maven自动生成项目站点的一些坑。 List maven-site-plugin 插件需要使用3.3版本，如果使用3.2，由于兼容性问题可能在site阶段报错。 Eclipse中启动mvn site阶段找不到JAVA_HOME： 报错信息如下： Failed to execute goal org.apache.maven.plugins:maven-ja...阅读全文>>